14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4429 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4429  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  304  2.0000000000000002e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0054  hypothetical protein  32.67 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2779  hypothetical protein  31.08 
 
 		 182 aa  60.5  0.000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.674461  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0956  hypothetical protein  31.62 
 
 		 167 aa  54.7  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.104469  normal  0.977999 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1100  hypothetical protein  31.62 
 
 		 167 aa  54.7  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0019  hypothetical protein  30.07 
 
 		 155 aa  51.6  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0276  hypothetical protein  29.75 
 
 		 184 aa  49.3  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.658235  normal  0.20807 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2674  hypothetical protein  28.03 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2015  hypothetical protein  29.86 
 
 		 146 aa  48.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.692203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4187  hypothetical protein  31.75 
 
 		 185 aa  47.8  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.431269 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3543  hypothetical protein  28.86 
 
 		 165 aa  47.8  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2295  hypothetical protein  28.97 
 
 		 184 aa  47  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3414  hypothetical protein  27.78 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1580  hypothetical protein  27.19 
 
 		 147 aa  40.4  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0680621  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>