26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_26240 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_26240  protein of unknown function DUF  100 
 
 		 104 aa  203  7e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2741  hypothetical protein  45.45 
 
 		 106 aa  54.3  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000241316  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0028  conserved hypothetical protein  37.66 
 
 		 120 aa  47  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03502  hypothetical protein  37.66 
 
 		 120 aa  47  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.760134  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5107  hypothetical protein  37.66 
 
 		 120 aa  47  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.315324 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4243  hypothetical protein  37.66 
 
 		 120 aa  47  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4041  hypothetical protein  37.66 
 
 		 120 aa  47  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.796724 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0025  hypothetical protein  37.66 
 
 		 120 aa  47  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3888  hypothetical protein  37.66 
 
 		 120 aa  47  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03559  predicted inner membrane protein  37.66 
 
 		 120 aa  47  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.795651  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4183  hypothetical protein  37.66 
 
 		 120 aa  47  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0020  hypothetical protein  44 
 
 		 118 aa  44.3  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3967  hypothetical protein  54.29 
 
 		 110 aa  43.5  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0928477  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0170  hypothetical protein  32.43 
 
 		 117 aa  43.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3697  hypothetical protein  52.78 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0150  hypothetical protein  40 
 
 		 105 aa  42.4  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3057  hypothetical protein  46.94 
 
 		 112 aa  42  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.269842  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4085  inner membrane protein YidG  40.58 
 
 		 120 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4134  hypothetical protein  40.58 
 
 		 120 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4013  inner membrane protein YidG  40.58 
 
 		 120 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.788767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4030  inner membrane protein YidG  40.58 
 
 		 120 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4192  inner membrane protein YidG  40.58 
 
 		 120 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3236  hypothetical protein  38.38 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0155  protein of unknown function DUF202  44.74 
 
 		 111 aa  40.4  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0384  protein of unknown function DUF202  44.29 
 
 		 123 aa  40.4  0.008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.860831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2928  hypothetical protein  62.5 
 
 		 107 aa  40  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>