11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0018 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0018  hypothetical protein  100 
 
 		 100 aa  203  6e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0022  hypothetical protein  83.33 
 
 		 105 aa  168  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1299  hypothetical protein  31.65 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.815847  normal  0.179686 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1650  hypothetical protein  43.14 
 
 		 161 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0567  hypothetical protein  55.56 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.615146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10429  hypothetical protein  39.53 
 
 		 91 aa  52  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000690872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2524  hypothetical protein  45.28 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3092  hypothetical protein  45.28 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2467  hypothetical protein  42.22 
 
 		 358 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00359465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1434  hypothetical protein  43.59 
 
 		 228 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.092829  normal  0.103223 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1672  hypothetical protein  31.51 
 
 		 166 aa  43.5  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.641045 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>