15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3868 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_3868  protein of unknown function DUF1634  100 
 
 
121 aa  232  1.0000000000000001e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0290618  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1650  protein of unknown function DUF1634  57.39 
 
 
118 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.12179  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2524  hypothetical protein  43.59 
 
 
125 aa  94  6e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0192345  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1844  hypothetical protein  42.5 
 
 
124 aa  83.6  8e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3309  protein of unknown function DUF1634  33.61 
 
 
132 aa  61.6  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.339425  hitchhiker  0.000416312 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0601  protein of unknown function DUF1634  32 
 
 
131 aa  58.5  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0944  hypothetical protein  34.19 
 
 
130 aa  55.1  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3911  hypothetical protein  35.09 
 
 
124 aa  50.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000126391  normal  0.0429532 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0269  hypothetical protein  29.75 
 
 
104 aa  48.5  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3138  protein of unknown function DUF1634  34.21 
 
 
119 aa  46.6  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0548  hypothetical protein  33.06 
 
 
127 aa  46.2  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.835755  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3318  hypothetical protein  33.01 
 
 
135 aa  44.7  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1198  hypothetical protein  23.73 
 
 
103 aa  44.3  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1909  hypothetical protein  31.65 
 
 
122 aa  44.7  0.0005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.110059  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0998  protein of unknown function DUF1634  39.68 
 
 
127 aa  42  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>