15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_1409 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_1409  hypothetical protein  100 
 
 
389 aa  802    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3066  hypothetical protein  45.12 
 
 
411 aa  328  7e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1188  hypothetical protein  41.25 
 
 
397 aa  283  4.0000000000000003e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000178859  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1037  hypothetical protein  42.34 
 
 
388 aa  275  1.0000000000000001e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.117843  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1056  hypothetical protein  42.34 
 
 
388 aa  275  1.0000000000000001e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.290999  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1232  hypothetical protein  42.04 
 
 
375 aa  271  2e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000219074  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2859  hypothetical protein  41.86 
 
 
378 aa  270  2.9999999999999997e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000759798  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1102  hypothetical protein  39.84 
 
 
379 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000164334  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0375  hypothetical protein  41.55 
 
 
362 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000123702  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1471  hypothetical protein  38.38 
 
 
379 aa  226  5.0000000000000005e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1203  hypothetical protein  32.11 
 
 
425 aa  184  3e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.79003  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1823  hypothetical protein  32.11 
 
 
425 aa  184  3e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1208  hypothetical protein  31.88 
 
 
436 aa  183  4.0000000000000006e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0121622  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1179  hypothetical protein  31.78 
 
 
425 aa  182  6e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3416  hypothetical protein  24.19 
 
 
463 aa  89  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.46551  hitchhiker  0.00552362 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>