23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9215 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_9215  hypothetical protein  100 
 
 
224 aa  456  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1454  Cell division protein-like protein  41.09 
 
 
301 aa  96.7  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.805507 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0794  hypothetical protein  38.64 
 
 
299 aa  85.5  6e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.580506  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3780  protein of unknown function DUF214  32.74 
 
 
301 aa  72.4  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4005  protein of unknown function DUF214  34.21 
 
 
301 aa  71.2  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1367  hypothetical protein  30.52 
 
 
287 aa  68.9  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1730  cell division protein FtsX  28.27 
 
 
306 aa  67.4  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2399  protein of unknown function DUF214  28.21 
 
 
304 aa  65.5  0.0000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0296581 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2664  cell division protein FtsX  27.35 
 
 
304 aa  61.6  0.000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.131472  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0919  hypothetical protein  28.21 
 
 
291 aa  60.1  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25180  cell division protein FtsX  30.88 
 
 
304 aa  58.5  0.00000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.293384  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2477  cell division protein FtsX  33.73 
 
 
302 aa  57.8  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.680753  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0865  cell division protein FtsX  31.25 
 
 
304 aa  57.4  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0983  hypothetical protein  27.4 
 
 
291 aa  56.6  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.62484  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1036  cell division protein FtsX  29.2 
 
 
304 aa  53.5  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3722  protein of unknown function DUF214  25.86 
 
 
303 aa  51.6  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.233251  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1678  protein of unknown function DUF214  26.89 
 
 
300 aa  51.2  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00327805  normal  0.350066 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20320  cell division protein  28.83 
 
 
305 aa  47.8  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1269  cell division protein FtsX  27.83 
 
 
303 aa  46.6  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.318969  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1245  protein of unknown function DUF214  28.93 
 
 
304 aa  46.2  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2768  protein of unknown function DUF214  29.41 
 
 
304 aa  45.4  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.427194 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5791  hypothetical protein  28.89 
 
 
290 aa  43.9  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.356635  normal  0.676846 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1235  protein of unknown function DUF214  28.68 
 
 
294 aa  44.3  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.43736  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>