15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8703 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_8703  hypothetical protein  100 
 
 
123 aa  251  3e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8674  hypothetical protein  90.32 
 
 
195 aa  173  7e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1524  metal dependent phosphohydrolase  67.61 
 
 
229 aa  90.1  9e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4858  metal dependent phosphohydrolase  56.79 
 
 
182 aa  85.5  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3030  metal dependent phosphohydrolase  38.55 
 
 
174 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8968  metal dependent phosphohydrolase  42.5 
 
 
186 aa  56.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0729344  normal  0.622726 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5596  metal dependent phosphohydrolase  38.75 
 
 
197 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5997  metal dependent phosphohydrolase  38.75 
 
 
197 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000525134 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3171  metal dependent phosphohydrolase  38.55 
 
 
155 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3233  metal dependent phosphohydrolase  38.55 
 
 
178 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.358695  normal  0.837173 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3183  metal dependent phosphohydrolase  38.55 
 
 
178 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.923465 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5334  metal dependent phosphohydrolase  39.02 
 
 
182 aa  50.8  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0727034 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1134  metal dependent phosphohydrolase  39.51 
 
 
182 aa  50.8  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.12835  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1720  metal dependent phophohydrolase  34.57 
 
 
187 aa  46.6  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000565777  normal  0.121963 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5474  metal dependent phosphohydrolase  38.55 
 
 
184 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.729398  normal  0.570702 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>