13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8471 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_8471  hypothetical protein  100 
 
 
812 aa  1584    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.503181  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3056  hypothetical protein  69.11 
 
 
657 aa  833    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.089114  normal  0.98238 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1101  hypothetical protein  42.24 
 
 
782 aa  405  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0146  hypothetical protein  36.69 
 
 
782 aa  352  1e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0478  hypothetical protein  35.27 
 
 
540 aa  179  1e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0887  hypothetical protein  24.85 
 
 
647 aa  65.5  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0927  hypothetical protein  20.81 
 
 
725 aa  59.7  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4736  hypothetical protein  23.09 
 
 
643 aa  56.2  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00027921 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07290  hypothetical protein  27.27 
 
 
642 aa  56.6  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1168  hypothetical protein  20.5 
 
 
985 aa  53.1  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4300  hypothetical protein  24.32 
 
 
644 aa  48.9  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.908642  normal  0.295604 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0233  hypothetical protein  18.87 
 
 
813 aa  47  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1446  hypothetical protein  28.21 
 
 
922 aa  44.7  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.09163  normal  0.0544825 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>