20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7328 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7328  hypothetical protein  100 
 
 		 124 aa  234  3e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.723791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11860  protein of unknown function (DUF477)  47.79 
 
 		 171 aa  96.3  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.334422 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1599  hypothetical protein  53.04 
 
 		 150 aa  93.6  8e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.233492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3518  hypothetical protein  47.83 
 
 		 132 aa  93.2  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1141  hypothetical protein  48.31 
 
 		 160 aa  89  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3893  hypothetical protein  45.22 
 
 		 137 aa  88.2  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.118959  normal  0.0968914 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1545  protein of unknown function DUF477  44.66 
 
 		 154 aa  79.3  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.159406  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4628  hypothetical protein  47.62 
 
 		 140 aa  78.6  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0203811 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1380  hypothetical protein  42.48 
 
 		 129 aa  77  0.00000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1827  hypothetical protein  38.94 
 
 		 152 aa  72.4  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000185967  normal  0.193956 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1159  hypothetical protein  41.84 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.417033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7337  hypothetical protein  43.1 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0971863  hitchhiker  0.000142423 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5307  hypothetical protein  36.28 
 
 		 133 aa  67  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.393038  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4061  hypothetical protein  36.36 
 
 		 158 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.911704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3607  hypothetical protein  32 
 
 		 161 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3612  hypothetical protein  32 
 
 		 161 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.443077 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3680  hypothetical protein  32 
 
 		 161 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.950227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2575  hypothetical protein  34.09 
 
 		 158 aa  40.8  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12493  hypothetical protein  32.97 
 
 		 167 aa  40.4  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.226542 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1395  hypothetical protein  28.95 
 
 		 160 aa  40  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00858881  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>