9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5146 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5146  hypothetical protein  100 
 
 		 131 aa  261  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.433259  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0077  hypothetical protein  72.22 
 
 		 131 aa  155  2e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.805113 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23640  hypothetical protein  58.59 
 
 		 131 aa  152  1e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0460  LexA DNA-binding domain protein  72.03 
 
 		 128 aa  143  6e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.953551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2431  hypothetical protein  53.91 
 
 		 113 aa  108  3e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0558  hypothetical protein  50 
 
 		 159 aa  67  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.770049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2433  hypothetical protein  43.7 
 
 		 163 aa  63.9  0.0000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2006  hypothetical protein  42.42 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.660541 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2705  HSP18 transcriptional regulator  42.86 
 
 		 227 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>