19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4172 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4172  hypothetical protein  100 
 
 		 118 aa  234  3e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2847  antibiotic biosynthesis monooxygenase  52.43 
 
 		 114 aa  104  4e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.727721 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2397  antibiotic biosynthesis monooxygenase  54.88 
 
 		 149 aa  96.7  9e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.306525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33740  extracellular polysaccharide biosynthesis protein  41.41 
 
 		 100 aa  82.8  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1084  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.96 
 
 		 378 aa  62.8  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.633077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2498  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.21 
 
 		 119 aa  61.6  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.800101  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3331  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.57 
 
 		 111 aa  57  0.00000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0617712  normal  0.119156 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2682  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.06 
 
 		 117 aa  50.8  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0290858  hitchhiker  0.00010796 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0499  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.17 
 
 		 96 aa  47.4  0.00007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2196  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.19 
 
 		 162 aa  45.1  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0294668  normal  0.4212 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2110  antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.97 
 
 		 95 aa  44.3  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00141622  hitchhiker  0.00245237 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4173  hypothetical protein  29.07 
 
 		 129 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.566225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2345  hypothetical protein  37.29 
 
 		 92 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0269669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0143  monooxygenase FAD-binding protein  32.1 
 
 		 968 aa  43.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4517  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.1 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.60105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0326  antibiotic biosynthesis monooxygenase  23.33 
 
 		 203 aa  40.8  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4144  hypothetical protein  27.5 
 
 		 121 aa  40.8  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0234014 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2396  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.25 
 
 		 107 aa  40.4  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.486739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33730  extracellular polysaccharide biosynthesis protein  24.44 
 
 		 113 aa  40.4  0.009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>