14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3434 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3434  major facilitator transporter  100 
 
 		 201 aa  382  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0145868  normal  0.232939 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3484  hypothetical protein  40.29 
 
 		 199 aa  82  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148513  normal  0.0471725 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2053  hypothetical protein  40.98 
 
 		 189 aa  76.3  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00648458  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3400  hypothetical protein  44.15 
 
 		 186 aa  72.4  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26535  normal  0.40854 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2985  hypothetical protein  39.79 
 
 		 185 aa  70.5  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000610885  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1775  hypothetical protein  31.61 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.741384  normal  0.308544 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4789  hypothetical protein  35.03 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.368691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3069  hypothetical protein  32.08 
 
 		 237 aa  58.2  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0580303  normal  0.0181586 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3081  hypothetical protein  34.55 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3580  hypothetical protein  36.32 
 
 		 186 aa  52.4  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30990  hypothetical protein  30.63 
 
 		 215 aa  48.5  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.115562  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4176  hypothetical protein  31.32 
 
 		 212 aa  45.4  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.80653 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4442  copper resistance protein CopC  31.08 
 
 		 424 aa  43.9  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0755  hypothetical protein  36.84 
 
 		 208 aa  43.5  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.012753 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>