15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4923 on replicon NC_009829
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009829  Spro_4923  hypothetical protein  100 
 
 
181 aa  369  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.129768 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2754  hypothetical protein  31.67 
 
 
187 aa  70.9  0.000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0729346 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1317  hypothetical protein  31.28 
 
 
187 aa  69.7  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0742606 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2584  hypothetical protein  31.28 
 
 
187 aa  69.7  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.952409  normal  0.283249 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2056  hypothetical protein  31.28 
 
 
187 aa  69.3  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0095823  normal  0.0117341 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2826  hypothetical protein  30.68 
 
 
183 aa  68.2  0.00000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1169  hypothetical protein  29.51 
 
 
215 aa  52.8  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3210  hypothetical protein  31.78 
 
 
188 aa  52.8  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1194  hypothetical protein  26.88 
 
 
193 aa  52  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0685797 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2415  hypothetical protein  26.38 
 
 
188 aa  47.4  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1890  hypothetical protein  25.84 
 
 
197 aa  44.3  0.0009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.028647  hitchhiker  0.0000305943 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0730  hypothetical protein  27.68 
 
 
179 aa  43.9  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5776  hypothetical protein  25.27 
 
 
197 aa  43.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3413  hypothetical protein  22.7 
 
 
189 aa  42  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.771681  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1041  hypothetical protein  25 
 
 
196 aa  42  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0872827  normal  0.0996489 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>