15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3898 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_3898  hypothetical protein  100 
 
 		 114 aa  225  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.568701  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5786  hypothetical protein  57.53 
 
 		 151 aa  69.7  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5430  hypothetical protein  48.86 
 
 		 113 aa  64.3  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00174485 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1188  hypothetical protein  40.19 
 
 		 123 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0811038  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1210  hypothetical protein  46.15 
 
 		 125 aa  61.6  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.957469  normal  0.31999 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1329  hypothetical protein  47.78 
 
 		 119 aa  58.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.238265 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2672  hypothetical protein  47.19 
 
 		 119 aa  57.4  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.233461  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1823  hypothetical protein  35.58 
 
 		 120 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.558886 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4289  hypothetical protein  37.27 
 
 		 123 aa  50.8  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4709  hypothetical protein  51.85 
 
 		 120 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0945846 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2772  hypothetical protein  57.14 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4666  hypothetical protein  54.35 
 
 		 118 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5175  hypothetical protein  51.85 
 
 		 120 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.207707  normal  0.211219 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4180  hypothetical protein  46 
 
 		 117 aa  43.5  0.0009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5247  hypothetical protein  53.33 
 
 		 120 aa  41.2  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>