11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1185 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1185  hypothetical protein  100 
 
 		 130 aa  257  5.0000000000000005e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.236431  normal  0.128134 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0527  hypothetical protein  38.13 
 
 		 135 aa  68.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.140936  normal  0.73102 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0059  hypothetical protein  38.1 
 
 		 132 aa  67  0.00000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0055  hypothetical protein  34.09 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.445419  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1888  hypothetical protein  41.05 
 
 		 126 aa  62  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.114407  normal  0.0243074 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7619  hypothetical protein  33.07 
 
 		 131 aa  61.2  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4212  hypothetical protein  33.82 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0313696  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0055  hypothetical protein  32.95 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1000  hypothetical protein  32.03 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2090  hypothetical protein  48.39 
 
 		 126 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.37782  normal  0.399658 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0942  hypothetical protein  37.5 
 
 		 135 aa  51.6  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.509897  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>