13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_19650 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_19650  hypothetical protein  100 
 
 		 255 aa  509  1e-143  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.377957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0325  hypothetical protein  35.27 
 
 		 257 aa  95.1  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.317043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5438  hypothetical protein  37.62 
 
 		 245 aa  93.2  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.126113 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1250  hypothetical protein  33.05 
 
 		 232 aa  71.2  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.786413  normal  0.718016 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4135  hypothetical protein  42.11 
 
 		 104 aa  55.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.981797  normal  0.358313 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4165  hypothetical protein  30.74 
 
 		 243 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0473223  normal  0.253487 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4922  hypothetical protein  30.59 
 
 		 263 aa  52  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.253652  normal  0.87794 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1530  hypothetical protein  29.46 
 
 		 243 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.531658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2541  hypothetical protein  26.97 
 
 		 241 aa  50.4  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.563205  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5106  hypothetical protein  28.87 
 
 		 244 aa  47.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1910  hypothetical protein  31.25 
 
 		 245 aa  45.8  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.167349  hitchhiker  0.000536118 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5460  protein of unknown function DUF1100 hydrolase family protein  24.23 
 
 		 424 aa  44.3  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.528765  normal  0.198358 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2552  hypothetical protein  23.16 
 
 		 235 aa  42.4  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0154484  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>