18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_2844 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_2844  hypothetical protein  100 
 
 
104 aa  215  1e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2737  hypothetical protein  93.27 
 
 
104 aa  201  3e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1449  hypothetical protein  81.73 
 
 
104 aa  180  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1415  hypothetical protein  81.73 
 
 
104 aa  180  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3637  hypothetical protein  50.98 
 
 
107 aa  108  3e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000244876  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7309  hypothetical protein  45.28 
 
 
107 aa  91.3  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.132993  hitchhiker  0.00291142 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3886  hypothetical protein  49.41 
 
 
179 aa  90.1  9e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.385994  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0338  hypothetical protein  43.69 
 
 
116 aa  78.2  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0073  hypothetical protein  39.81 
 
 
119 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000324205  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4405  hypothetical protein  37.86 
 
 
116 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.651737  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3280  hypothetical protein  38.24 
 
 
107 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00388301  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2234  hypothetical protein  36.45 
 
 
107 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.32569e-35 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0544  hypothetical protein  47.14 
 
 
83 aa  65.1  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1077  hypothetical protein  37.17 
 
 
112 aa  61.2  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.314004  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3282  hypothetical protein  42.86 
 
 
66 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0267847  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1302  hypothetical protein  32.32 
 
 
219 aa  47.8  0.00005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.443102  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0431  hypothetical protein  25.93 
 
 
119 aa  47.8  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3849  hypothetical protein  29.21 
 
 
106 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>