15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_1855 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_1855  hypothetical protein  100 
 
 
275 aa  569  1e-161  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2176  hypothetical protein  92.36 
 
 
275 aa  530  1e-150  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1801  hypothetical protein  91.64 
 
 
275 aa  526  1e-148  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2075  hypothetical protein  90.18 
 
 
275 aa  517  1e-146  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1874  hypothetical protein  72.16 
 
 
273 aa  431  1e-120  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000344156  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0514  hypothetical protein  51.64 
 
 
269 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000448913  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2316  hypothetical protein  36.75 
 
 
272 aa  169  5e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4993  hypothetical protein  23.84 
 
 
266 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0893  hypothetical protein  26.29 
 
 
319 aa  53.5  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.196658  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1194  hypothetical protein  23.91 
 
 
296 aa  50.4  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2810  hypothetical protein  21.98 
 
 
297 aa  47  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2893  hypothetical protein  21.98 
 
 
297 aa  47  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2990  hypothetical protein  23.36 
 
 
295 aa  46.6  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1382  hypothetical protein  21.77 
 
 
308 aa  43.9  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0868  hypothetical protein  25.81 
 
 
388 aa  42.7  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>