299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_R0075 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_R0075  tRNA-Asn  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000218117  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t048  tRNA-Asn  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t049  tRNA-Asn  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t050  tRNA-Asn  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t051  tRNA-Asn  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t052  tRNA-Asn  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0051  tRNA-Asn  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000000657553  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_t10  tRNA-Asn  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_t08  tRNA-Asn  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_t07  tRNA-Asn  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0053  tRNA-Asn  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000303697  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0049  tRNA-Asn  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000796126  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0052  tRNA-Asn  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000000813258  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0050  tRNA-Asn  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000774224  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_t09  tRNA-Asn  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0061  tRNA-Asn  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000104416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0054  tRNA-Asn  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000000507687  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0051  tRNA-Asn  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000000473261  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0054  tRNA-Asn  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000490544  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0062  tRNA-Asn  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000100655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0098  tRNA-Asn  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000305665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0099  tRNA-Asn  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000305665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0100  tRNA-Asn  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0101  tRNA-Asn  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000753744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0102  tRNA-Asn  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000804325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0088  tRNA-Asn  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000246842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0089  tRNA-Asn  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000235445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0090  tRNA-Asn  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000121304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0091  tRNA-Asn  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000108564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0092  tRNA-Asn  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000095215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0064  tRNA-Asn  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000482933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0063  tRNA-Asn  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000473175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0065  tRNA-Asn  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000102168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0052  tRNA-Asn  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000046845  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0055  tRNA-Asn  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000000533833  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0053  tRNA-Asn  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000000454506  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0095  tRNA-Asn  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000000680778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0096  tRNA-Asn  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000000783428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0097  tRNA-Asn  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000000767746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0098  tRNA-Asn  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000000647145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0099  tRNA-Asn  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000000653794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0073  tRNA-Asn  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000150296  normal  0.355745 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0074  tRNA-Asn  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000414669  normal  0.355745 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0075  tRNA-Asn  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000399431  normal  0.351937 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0076  tRNA-Asn  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000334137  normal  0.214908 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0077  tRNA-Asn  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000290046  normal  0.214908 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0053  tRNA-Asn  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000495579  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0052  tRNA-Asn  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000553909  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0051  tRNA-Asn  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000466422  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t081  tRNA-Asn  98.67 
 
 		 76 bp  141  3e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000129685  normal  0.647259 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t080  tRNA-Asn  98.67 
 
 		 76 bp  141  3e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000127089  normal  0.640571 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t082  tRNA-Asn  98.67 
 
 		 76 bp  141  3e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000111549  normal  0.635304 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t078  tRNA-Asn  98.67 
 
 		 76 bp  141  3e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000116126  normal  0.643909 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t079  tRNA-Asn  98.67 
 
 		 76 bp  141  3e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000110415  normal  0.651496 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00034  tRNA-Asn  98.61 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.107605  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00035  tRNA-Asn  98.61 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0182063  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00036  tRNA-Asn  98.61 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00807096  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0039  tRNA-Asn  98.61 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000583297  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0040  tRNA-Asn  98.61 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000809411  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0041  tRNA-Asn  98.61 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000608298  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0042  tRNA-Asn  98.61 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0486048  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4674  tRNA-Asn  98.61 
 
 		 78 bp  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.04285e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0055  tRNA-Asn  98.61 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0679012 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0054  tRNA-Asn  98.61 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0020745  normal  0.0821499 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4673  tRNA-Asn  98.61 
 
 		 78 bp  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.54292e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4235  tRNA-Asn  98.61 
 
 		 78 bp  135  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000287726  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0072  tRNA-Asn  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0416194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0068  tRNA-Asn  98.61 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0067  tRNA-Asn  98.61 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.057405  normal  0.869795 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0118  tRNA-Asn  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000046805  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0121  tRNA-Asn  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000117493  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0120  tRNA-Asn  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102626  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0122  tRNA-Asn  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000124513  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4241  tRNA-Asn  98.61 
 
 		 78 bp  135  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  5.07501e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4676  tRNA-Asn  98.61 
 
 		 78 bp  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.2991999999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5043  tRNA-Asn  98.61 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000344379  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0025  tRNA-Asn  98.61 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.253153  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4675  tRNA-Asn  98.61 
 
 		 78 bp  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.10432e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5041  tRNA-Asn  98.61 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000117093  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5044  tRNA-Asn  98.61 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306715  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0044  tRNA-Asn  98.61 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000371151  hitchhiker  0.00258348 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0026  tRNA-Asn  98.61 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.332926  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0045  tRNA-Asn  98.61 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000000379772  normal  0.0321214 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0046  tRNA-Asn  98.61 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000000733647  normal  0.0337156 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0069  tRNA-Asn  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0448406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0069  tRNA-Asn  98.61 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000387596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0119  tRNA-Asn  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000444921  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0070  tRNA-Asn  98.61 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.263184 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0123  tRNA-Asn  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000114106  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0124  tRNA-Asn  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141621  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2105  tRNA-Asn  98.61 
 
 		 78 bp  135  1.9999999999999998e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000627043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4240  tRNA-Asn  98.61 
 
 		 78 bp  135  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  6.488670000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5042  tRNA-Asn  98.61 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000464951  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0068  tRNA-Asn  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0474424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0077  tRNA-Asn  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000220166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0053  tRNA-Asn  98.61 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00100848  normal  0.0860843 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0070  tRNA-Asn  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.042051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0071  tRNA-Asn  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0401239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0074  tRNA-Asn  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0206519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0073  tRNA-Asn  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0422626  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>