22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1988 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_1988  hypothetical protein  100 
 
 		 126 aa  251  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.727763  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0465  hypothetical protein  33.33 
 
 		 114 aa  53.9  0.0000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1067  hypothetical protein  28.87 
 
 		 117 aa  52.8  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.201383 
 
 
-
 
NC_004310  BR0312  hypothetical protein  25.71 
 
 		 117 aa  51.2  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0326  hypothetical protein  24.76 
 
 		 117 aa  51.2  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.402974  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0556  hypothetical protein  29.52 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0405  hypothetical protein  24.44 
 
 		 116 aa  47.8  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0513  hypothetical protein  28.57 
 
 		 121 aa  47.8  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.11264  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0548  hypothetical protein  24.77 
 
 		 116 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.303281  normal  0.0576469 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0756  hypothetical protein  28.26 
 
 		 114 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.824326  normal  0.356422 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2059  protein of unknown function DUF952  25.74 
 
 		 116 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0387  hypothetical protein  24.55 
 
 		 114 aa  44.7  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.580664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2383  protein of unknown function DUF952  27.17 
 
 		 116 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2107  hypothetical protein  27.17 
 
 		 116 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.808396  normal  0.0238058 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0792  hypothetical protein  26.97 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00855972 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4623  hypothetical protein  26.88 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0436  hypothetical protein  27.1 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3257  hypothetical protein  23.93 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.55891  normal  0.0949629 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0864  protein of unknown function DUF952  23.66 
 
 		 114 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.781943  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4536  protein of unknown function DUF952  26.44 
 
 		 115 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.359065  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2616  hypothetical protein  27.1 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0956  hypothetical protein  27.1 
 
 		 112 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>