18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C1858 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A1796  putative outer membrane lipoprotein  100 
 
 		 53 aa  107  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0696104  normal  0.0893416 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1858  hypothetical protein  100 
 
 		 53 aa  107  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1478  putative outer membrane lipoprotein  100 
 
 		 53 aa  107  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1659  putative outer membrane lipoprotein  98.11 
 
 		 53 aa  107  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.140597 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1798  hypothetical protein  95.83 
 
 		 78 aa  98.2  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.467044  normal  0.372987 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1700  hypothetical protein  48.84 
 
 		 62 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0250469  normal  0.453188 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1764  hypothetical protein  48.84 
 
 		 73 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.133159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1703  hypothetical protein  48.84 
 
 		 62 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00741738  normal  0.280007 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1575  hypothetical protein  48.84 
 
 		 73 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000133962  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1756  hypothetical protein  46.51 
 
 		 73 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00665252  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3179  protein of unknown function DUF903  40.43 
 
 		 73 aa  42.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.854338  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3827  hypothetical protein  41.3 
 
 		 72 aa  42  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00127821  normal  0.447388 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3021  protein of unknown function DUF903  41.3 
 
 		 72 aa  40.8  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00037767  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3172  hypothetical protein  41.3 
 
 		 72 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0402185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3154  hypothetical protein  41.3 
 
 		 72 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0064059  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3220  hypothetical protein  41.3 
 
 		 72 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0872194  hitchhiker  0.00083353 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3235  hypothetical protein  41.3 
 
 		 72 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00978662  hitchhiker  0.00000128975 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3335  hypothetical protein  41.3 
 
 		 72 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0912863  hitchhiker  0.00963527 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>