18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1617 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1617  cellulose-binding family II protein  100 
 
 		 243 aa  491  9.999999999999999e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000306193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2483  DsrE protein  27.35 
 
 		 119 aa  56.6  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0554665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1953  DsrE family protein  27.35 
 
 		 119 aa  56.2  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.370891  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2187  sulfur relay protein TusD/DsrE  26.19 
 
 		 130 aa  55.8  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.719942  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3598  sulfur transfer complex subunit TusD  26.4 
 
 		 130 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.276941 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3993  sulfur transfer complex subunit TusD  26.4 
 
 		 130 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0220527  hitchhiker  0.0053466 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1655  DsrE family protein  25.64 
 
 		 119 aa  54.7  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2377  sulfur transfer complex subunit TusD  26.4 
 
 		 130 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.278614  normal  0.0314331 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1840  sulfur transfer complex subunit TusD  26.4 
 
 		 143 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000217326 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3397  sulfur transfer complex subunit TusD  24.8 
 
 		 130 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.452785 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28120  sulfur transfer complex subunit TusD  23.2 
 
 		 130 aa  51.2  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3168  sulfur transfer complex subunit TusD  23.2 
 
 		 130 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.209612  normal  0.265981 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1331  intracellular sulfur oxidation protein DsrE  25 
 
 		 123 aa  49.3  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2603  sulfur transfer complex subunit TusD  24 
 
 		 131 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30400  sulfur transfer complex subunit TusD  25.58 
 
 		 131 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1519  DsrE family protein  25.24 
 
 		 136 aa  45.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.653687  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3338  DsrE family protein  22.4 
 
 		 130 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.341963  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3575  sulfur transfer complex subunit TusD  27.37 
 
 		 140 aa  42  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462217 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>