17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_2634 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_2634  hypothetical protein  100 
 
 
115 aa  239  9e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.366542  decreased coverage  0.0000000149114 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3274  hypothetical protein  69.57 
 
 
115 aa  174  4e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000990273  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3264  hypothetical protein  70.43 
 
 
115 aa  170  6.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1851  hypothetical protein  70.43 
 
 
115 aa  169  1e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000453676  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1968  hypothetical protein  70.43 
 
 
115 aa  169  1e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00451275  normal  0.0944215 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3401  hypothetical protein  70.43 
 
 
115 aa  169  1e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000727987 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2010  hypothetical protein  70.43 
 
 
115 aa  169  2e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000560852  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0733  hypothetical protein  69.57 
 
 
115 aa  167  3e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00894995  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3377  hypothetical protein  69.57 
 
 
115 aa  167  3e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000430463  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1961  hypothetical protein  69.57 
 
 
115 aa  167  5e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000389252  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3499  hypothetical protein  69.57 
 
 
115 aa  167  5e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000605217  unclonable  0.00000956134 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3621  hypothetical protein  68.7 
 
 
115 aa  166  1e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0156386  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2569  hypothetical protein  68.7 
 
 
115 aa  166  1e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00085158  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0758  hypothetical protein  68.7 
 
 
115 aa  166  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00108452  normal  0.0210238 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0762  hypothetical protein  68.7 
 
 
115 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000433319  unclonable  0.0000106133 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1644  hypothetical protein  60.36 
 
 
111 aa  140  5e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000796816  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1540  hypothetical protein  38.1 
 
 
74 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0678673 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>