15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4187 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_4187  hypothetical protein  100 
 
 
205 aa  415  9.999999999999999e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.491215  hitchhiker  0.00189431 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2562  hypothetical protein  38.29 
 
 
179 aa  92.8  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.730966  normal  0.6378 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7738  hypothetical protein  31.43 
 
 
169 aa  74.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0206837  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3755  hypothetical protein  29.61 
 
 
186 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0031  redoxin  27.61 
 
 
201 aa  47  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3603  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.35 
 
 
183 aa  47  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2509  putative thiol:disulfide interchange protein  23.81 
 
 
165 aa  45.8  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.343954  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2010  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.79 
 
 
399 aa  44.3  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0525  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  21.43 
 
 
178 aa  43.9  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000136072  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0183  Redoxin domain protein  27.03 
 
 
154 aa  43.5  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02625  hypothetical protein  22.22 
 
 
466 aa  43.1  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2431  putative thioredoxin  31.43 
 
 
164 aa  42.7  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3001  redoxin domain-containing protein  29.51 
 
 
196 aa  42.7  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0287871  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2261  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.62 
 
 
191 aa  42.4  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.124304  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1661  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.71 
 
 
192 aa  42.4  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>