17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2952 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2952  methylaspartate mutase E subunit  100 
 
 
471 aa  947    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.35674  normal  0.0474481 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4361  Methylaspartate mutase  56.68 
 
 
451 aa  451  1.0000000000000001e-126  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.722413 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6166  Methylaspartate mutase  52.68 
 
 
460 aa  449  1e-125  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00537861 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15440  Glutamate mutase subunit E  41.53 
 
 
483 aa  303  3.0000000000000004e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000246977  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2981  methylaspartate mutase, E subunit  43.42 
 
 
479 aa  285  1.0000000000000001e-75  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1345  methylaspartate mutase, E subunit  42.82 
 
 
483 aa  282  8.000000000000001e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3335  methylaspartate mutase, E subunit  38.12 
 
 
479 aa  271  2e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1593  methylaspartate mutase, E subunit  37.62 
 
 
479 aa  268  1e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2690  methylaspartate mutase, E subunit  41.09 
 
 
483 aa  265  1e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.997917  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0750  methylaspartate mutase, E subunit  38.71 
 
 
481 aa  265  2e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0830  methylaspartate mutase, E subunit  38.71 
 
 
481 aa  265  2e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4401  methylaspartate mutase, E subunit  41.86 
 
 
484 aa  260  3e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2236  methylaspartate mutase, E subunit  37.77 
 
 
485 aa  251  3e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0784042  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3405  methylaspartate mutase, E subunit  32.55 
 
 
646 aa  204  3e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.70543 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6323  methylaspartate mutase E subunit  32.45 
 
 
457 aa  155  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal  0.361913 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1955  hypothetical protein  27.25 
 
 
469 aa  135  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.61481 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3042  hypothetical protein  37.14 
 
 
80 aa  43.9  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.660761  normal  0.0523491 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>