11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1180 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1290  hypothetical protein  100 
 
 		 119 aa  123  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.175567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1180  hypothetical protein  100 
 
 		 64 aa  121  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.192908  hitchhiker  0.000162176 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2123  hypothetical protein  67.19 
 
 		 64 aa  93.6  9e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0369772 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2777  hypothetical protein  56.06 
 
 		 64 aa  57.4  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.506284  normal  0.144879 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0215  hypothetical protein  52.38 
 
 		 63 aa  56.6  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3430  hypothetical protein  55.88 
 
 		 65 aa  55.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7992  hypothetical protein  53.85 
 
 		 64 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.645752  normal  0.42394 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1144  hypothetical protein  52.31 
 
 		 65 aa  52.8  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.717129  decreased coverage  0.00895911 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1571  hypothetical protein  47.06 
 
 		 67 aa  51.6  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0631142 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4026  hypothetical protein  49.25 
 
 		 63 aa  43.9  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8009  hypothetical protein  45.07 
 
 		 69 aa  40.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>