19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0124 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0124  hypothetical protein  100 
 
 
140 aa  263  4e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000227824 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0865  hypothetical protein  56.43 
 
 
141 aa  151  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.94497 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2235  hypothetical protein  58.06 
 
 
140 aa  130  6e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0702  protein of unknown function DUF350  51.22 
 
 
143 aa  123  8.000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.406118  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1155  protein of unknown function DUF350  50.74 
 
 
148 aa  121  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.735897  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5175  protein of unknown function DUF350  46.09 
 
 
142 aa  115  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4693  hypothetical protein  43.85 
 
 
147 aa  95.9  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12619  integral membrane protein  37.59 
 
 
133 aa  89.4  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.951061  normal  0.527246 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0681  protein of unknown function DUF350  34.48 
 
 
151 aa  85.5  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2756  protein of unknown function DUF350  39.84 
 
 
138 aa  84  7e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7052  hypothetical protein  34.78 
 
 
159 aa  77.4  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01250  protein of unknown function (DUF350)  37.8 
 
 
148 aa  73.9  0.0000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.993492  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1863  hypothetical protein  33.09 
 
 
151 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.513538  normal  0.089814 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1883  hypothetical protein  32.37 
 
 
170 aa  70.5  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0848062  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1929  hypothetical protein  32.37 
 
 
151 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.139772  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2138  protein of unknown function DUF350  38.58 
 
 
139 aa  67.8  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2364  hypothetical protein  37.59 
 
 
152 aa  67.4  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0206776 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1574  protein of unknown function DUF350  37.3 
 
 
149 aa  67.4  0.00000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00727818  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0116  protein of unknown function DUF350  37.3 
 
 
150 aa  47.4  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>