25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2007 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_2007  hypothetical protein  100 
 
 
333 aa  684    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.803943 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2127  hypothetical protein  22.14 
 
 
279 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0511  hypothetical protein  24.86 
 
 
275 aa  69.3  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4726  hypothetical protein  21.9 
 
 
275 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1711  hypothetical protein  25.41 
 
 
283 aa  64.3  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4750  hypothetical protein  21.69 
 
 
275 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1761  hypothetical protein  23.62 
 
 
267 aa  61.2  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.828673  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4358  hypothetical protein  21.95 
 
 
274 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4349  hypothetical protein  23.41 
 
 
275 aa  60.5  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4733  hypothetical protein  23.5 
 
 
275 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4864  hypothetical protein  23.5 
 
 
275 aa  58.5  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4511  hypothetical protein  23.5 
 
 
275 aa  58.5  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1963  hypothetical protein  29.78 
 
 
264 aa  55.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3351  hypothetical protein  22.33 
 
 
279 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1880  hypothetical protein  22.33 
 
 
279 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3136  hypothetical protein  20.39 
 
 
279 aa  52.8  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.147015  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3373  hypothetical protein  20.39 
 
 
279 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00104836  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3149  hypothetical protein  20.39 
 
 
279 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3371  hypothetical protein  20.39 
 
 
279 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3396  hypothetical protein  20.39 
 
 
279 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.812003  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3044  hypothetical protein  20.39 
 
 
279 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3369  hypothetical protein  22.4 
 
 
279 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3075  hypothetical protein  21.76 
 
 
279 aa  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2030  hypothetical protein  47.73 
 
 
130 aa  50.4  0.00004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0671  hypothetical protein  23.74 
 
 
325 aa  49.7  0.00006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.007098  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>