73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0935 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0935  glutaredoxin family protein  100 
 
 
81 aa  160  4.0000000000000004e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000753733  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0856  redox-active disulfide protein 2  40.85 
 
 
75 aa  57  0.00000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3389  hypothetical protein  36.92 
 
 
172 aa  56.6  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0597569 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4061  redox-active disulfide protein 2  41.54 
 
 
77 aa  55.8  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.564529  normal  0.892222 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1877  redox-active disulfide protein 2  35.21 
 
 
76 aa  53.1  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0399  redox-active disulfide protein 2  39.24 
 
 
98 aa  53.1  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.11443  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0508  redox-active disulfide protein 2  37.18 
 
 
77 aa  52.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0111  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins  33.33 
 
 
77 aa  51.2  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1300  redox-active disulfide protein 2  39.73 
 
 
75 aa  50.8  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0185  putative thioredoxin  40 
 
 
77 aa  50.4  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2843  glutaredoxin  30.99 
 
 
79 aa  50.8  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.486982  hitchhiker  0.00945074 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4599  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins  32.91 
 
 
78 aa  50.4  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.81041  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1705  redox-active disulfide protein 2  33.77 
 
 
94 aa  50.4  0.000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.820671 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0752  redox-active disulfide protein 2  33.33 
 
 
78 aa  49.7  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0355259 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2564  redox-active disulfide protein 2  44.07 
 
 
75 aa  50.1  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000509192  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2180  redox-active disulfide protein 2  36.11 
 
 
75 aa  49.7  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000368742  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1116  redox-active disulfide protein 2  35.44 
 
 
77 aa  49.3  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0901427 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1429  thiol-disulfide isomerase/thioredoxin  29.11 
 
 
77 aa  48.9  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1090  redox-active disulfide protein 2  36.84 
 
 
77 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1475  redox-active disulfide protein 2  39.34 
 
 
99 aa  48.5  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.337383  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0462  redox-active disulfide protein 2  30.38 
 
 
78 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000236165  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0943  redox-active disulfide protein 2  37.66 
 
 
77 aa  48.5  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1028  redox-active disulfide protein 2  36.84 
 
 
77 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1903  redox-active disulfide protein 2  41.27 
 
 
77 aa  48.1  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.76321  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3642  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins  30.99 
 
 
78 aa  48.1  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0586  redox-active disulfide protein 2  40.35 
 
 
79 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1782  redox-active disulfide protein 2  34.92 
 
 
79 aa  47.8  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.889289  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3660  redox-active disulfide protein 2  40.28 
 
 
81 aa  47.8  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3648  redox-active disulfide protein 2  36.84 
 
 
77 aa  47.4  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.714541 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4013  redox-active disulfide protein 2  32.88 
 
 
77 aa  47  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3619  redox-active disulfide protein 2  34 
 
 
79 aa  47  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1624  redox-active disulfide protein 2  38.6 
 
 
81 aa  47  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000124454  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0493  redox-active disulfide protein 2  33.33 
 
 
78 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2956  redox-active disulfide protein 2  35.53 
 
 
78 aa  46.6  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3191  thiol-disulfide isomerase/thioredoxin  26.67 
 
 
78 aa  45.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3831  redox-active disulfide protein 2  33.33 
 
 
78 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1907  redox-active disulfide protein 2  30.77 
 
 
78 aa  45.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0881518  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3957  redox-active disulfide protein 2  33.33 
 
 
78 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3775  redox-active disulfide protein 2  33.33 
 
 
78 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0546  redox-active disulfide protein 2  36.84 
 
 
79 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000058449  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0487  redox-active disulfide protein 2  31.17 
 
 
82 aa  46.2  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2025  redox-active disulfide protein 2  30.77 
 
 
78 aa  45.8  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4203  putative glutaredoxin family protein/Thio-disulfide isomerase  32.84 
 
 
76 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0518  redox-active disulfide protein 2  38.1 
 
 
75 aa  45.4  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1620  redox-active disulfide protein 2  29.85 
 
 
174 aa  45.4  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1221  redox-active disulfide protein 2  35.82 
 
 
76 aa  43.9  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2948  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins  31.94 
 
 
79 aa  43.5  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.960362  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3598  redox-active disulfide protein 2  30.88 
 
 
77 aa  43.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.420898 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4075  thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  33.85 
 
 
78 aa  42.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00438322  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1869  hypothetical protein  28.57 
 
 
193 aa  43.5  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.383251  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1708  redox-active disulfide protein 2  30.14 
 
 
79 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1409  hypothetical protein  37.31 
 
 
75 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.34966  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1067  redox-active disulfide protein 2  31.82 
 
 
100 aa  43.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0536  redox-active disulfide protein 2  32 
 
 
78 aa  42.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0730  redox-active disulfide protein 2  30.43 
 
 
114 aa  42.4  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000429418  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3420  thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  29.11 
 
 
78 aa  42.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1726  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins  33.33 
 
 
76 aa  42.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.597532  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0436  redox-active disulfide protein 2  34.92 
 
 
76 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1710  hypothetical protein  32.5 
 
 
99 aa  42  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0068017  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0535  redox-active disulfide protein 2  32 
 
 
78 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3496  redox-active disulfide protein 2  32 
 
 
78 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5315  redox-active disulfide protein 2  38.18 
 
 
78 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.31849  normal  0.0964369 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3336  redox-active disulfide protein 2  29.49 
 
 
85 aa  42  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0827  redox-active disulfide protein 2  34.62 
 
 
78 aa  42  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000837608  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1829  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins  32.05 
 
 
78 aa  41.6  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.813005  normal  0.88262 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1856  redox-active disulfide protein 2  32.35 
 
 
80 aa  41.2  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.227349  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3943  thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  32.31 
 
 
90 aa  41.6  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0588  redox-active disulfide protein 2  29.49 
 
 
77 aa  41.2  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3416  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins  27.69 
 
 
78 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.369553  normal  0.899419 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2047  redox-active disulfide protein 2  34.67 
 
 
95 aa  40.8  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1184  redox-active disulfide protein 2  34.92 
 
 
75 aa  40.4  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0018  redox-active disulfide protein 2  32.88 
 
 
77 aa  40  0.01  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0691  redox-active disulfide protein 2  30.99 
 
 
77 aa  40  0.01  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.322744  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>