20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2664 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2664  hypothetical protein  100 
 
 		 97 aa  199  7e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1643  hypothetical protein  40.74 
 
 		 98 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000814258  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3624  hypothetical protein  40.45 
 
 		 102 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.112813  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1957  hypothetical protein  40.45 
 
 		 97 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000410187  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2006  hypothetical protein  40.45 
 
 		 102 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000859578  normal  0.733432 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1964  hypothetical protein  40.45 
 
 		 97 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0384493  normal  0.16929 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2572  hypothetical protein  40.45 
 
 		 97 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00867256  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0754  hypothetical protein  40.45 
 
 		 97 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0770842  hitchhiker  0.00580097 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0761  hypothetical protein  40.45 
 
 		 97 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000626283  unclonable  0.0000109526 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0732  hypothetical protein  41.98 
 
 		 97 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0131074  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3378  hypothetical protein  41.98 
 
 		 97 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000698785  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1848  hypothetical protein  41.46 
 
 		 92 aa  67  0.00000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00414677  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3404  hypothetical protein  41.46 
 
 		 97 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000741526 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3267  hypothetical protein  41.46 
 
 		 98 aa  67  0.00000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0685773  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3503  hypothetical protein  41.98 
 
 		 97 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.10352  hitchhiker  0.000148618 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3276  hypothetical protein  36.36 
 
 		 88 aa  58.9  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00532839  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2639  hypothetical protein  41.18 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.734029  hitchhiker  0.00000253554 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3003  hypothetical protein  40.91 
 
 		 115 aa  56.2  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0715  hypothetical protein  37.31 
 
 		 117 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0233457 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2919  hypothetical protein  39.47 
 
 		 86 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.387641 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>