16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0787 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0787  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  300  3.0000000000000004e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4063  hypothetical protein  35.2 
 
 		 148 aa  72.4  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000498867 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2638  hypothetical protein  29.37 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2205  hypothetical protein  28.57 
 
 		 140 aa  57  0.00000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.323725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0486  hypothetical protein  29.41 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.609033  normal  0.182465 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2260  hypothetical protein  27.27 
 
 		 140 aa  47.8  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2066  hypothetical protein  26.92 
 
 		 164 aa  45.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.126661  normal  0.369814 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0583  hypothetical protein  28.23 
 
 		 140 aa  45.1  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2236  hypothetical protein  28.23 
 
 		 140 aa  45.1  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.866818 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0789  hypothetical protein  24.79 
 
 		 136 aa  44.3  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0740  hypothetical protein  24.79 
 
 		 136 aa  44.3  0.0006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3970  hypothetical protein  23.97 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5158  hypothetical protein  24.41 
 
 		 170 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2503  hypothetical protein  27.78 
 
 		 350 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.231485  normal  0.462239 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3038  hypothetical protein  27.27 
 
 		 132 aa  42  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2348  hypothetical protein  24.31 
 
 		 145 aa  40.8  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0269343  normal  0.0953844 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>