17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A1640 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A1808    99.05 
 
 		 948 bp  1808    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0697266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1643    98.52 
 
 		 948 bp  1768    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000566767  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1632    99.16 
 
 		 948 bp  1816    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.718831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1699    99.37 
 
 		 948 bp  1832    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.53809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1640    100 
 
 		 948 bp  1879    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2014  hypothetical protein  80.94 
 
 		 915 bp  141  4e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00931147  normal  0.0815668 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2126  protein of unknown function UPF0187  81.78 
 
 		 915 bp  115  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0815429  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01488  hypothetical protein  81.78 
 
 		 915 bp  115  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2133  hypothetical protein  81.78 
 
 		 915 bp  115  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.337926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2138  hypothetical protein  81.78 
 
 		 915 bp  115  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1720  hypothetical protein  81.78 
 
 		 966 bp  115  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.219104  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1602  hypothetical protein  81.78 
 
 		 966 bp  115  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.738962  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01477  conserved inner membrane protein  81.78 
 
 		 915 bp  115  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1689  hypothetical protein  81.31 
 
 		 966 bp  107  6e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00204582  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1652  hypothetical protein  81.46 
 
 		 915 bp  105  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.066565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3128  hypothetical protein  82.11 
 
 		 918 bp  54  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1123  iron-sulfur cluster-binding protein  96.43 
 
 		 1662 bp  48.1  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>