20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1541 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1541  hypothetical protein  100 
 
 
134 aa  277  4e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00208719  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2743  YolD-like protein  39.23 
 
 
138 aa  103  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.459743  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2820  YolD-like protein  39.23 
 
 
138 aa  103  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2012  hypothetical protein  38.89 
 
 
133 aa  102  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1979  hypothetical protein  38.89 
 
 
133 aa  102  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.075101  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0047  hypothetical protein  31.48 
 
 
113 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000177049  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0095  hypothetical protein  32.41 
 
 
113 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000715846  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3280  hypothetical protein  34.86 
 
 
113 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3054  hypothetical protein  33.94 
 
 
113 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3289  hypothetical protein  33.94 
 
 
113 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0139  hypothetical protein  29.25 
 
 
116 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0062  hypothetical protein  29.63 
 
 
113 aa  61.2  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3151  IG hypothetical 15966  24.49 
 
 
115 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.120304 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2638  IG hypothetical 15966  31.34 
 
 
123 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3146  hypothetical protein  31.91 
 
 
93 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0007  hypothetical protein  28.87 
 
 
96 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0330  hypothetical protein  30.85 
 
 
93 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0863  YolD-like protein  25.69 
 
 
113 aa  43.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1458  hypothetical protein  58.62 
 
 
45 aa  42  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000294781  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3623  hypothetical protein  27.78 
 
 
106 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>