19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1464 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1464  Tn554-related, transposase C  100 
 
 		 121 aa  231  2.0000000000000002e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000016421  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3149  Tn554-related, transposase C  42.06 
 
 		 126 aa  99.4  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0002  Tn554-related, transposase C  42.06 
 
 		 126 aa  99.4  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00851987  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0988  Tn554-related, transposase C  46.39 
 
 		 131 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.167776  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1345  Tn554, transposase C  47.12 
 
 		 125 aa  69.7  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.48527  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2508  transposase C  47.12 
 
 		 125 aa  69.7  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1222  Tn554, transposase C  47.12 
 
 		 125 aa  69.7  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.406172  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1749  transposase C  47.12 
 
 		 125 aa  69.7  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0515142  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0041  transposase C  47.12 
 
 		 125 aa  69.7  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0041  hypothetical protein  47.12 
 
 		 125 aa  69.7  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1715  hypothetical protein  47.12 
 
 		 125 aa  69.7  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4538  transposase C  40.23 
 
 		 90 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4148  hypothetical protein  31.9 
 
 		 167 aa  55.1  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.798173  normal  0.299443 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3902  Tn554-related, transposase C  30.1 
 
 		 147 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0694  Tn554-related, transposase C  29.13 
 
 		 147 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5933  Tn554-related, transposase C  30.1 
 
 		 147 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3898  Tn554-related, transposase C  30.1 
 
 		 147 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.768404 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0480  Tn554-related, transposase C  30.1 
 
 		 147 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0070  hypothetical protein  36.36 
 
 		 148 aa  40.8  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>