30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1016 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1016  hypothetical protein  100 
 
 
112 aa  224  4e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.477376  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1534  hypothetical protein  89.47 
 
 
114 aa  192  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.365431  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1505  hypothetical protein  89.47 
 
 
114 aa  192  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.252808  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1281  DivIVA family protein  50 
 
 
111 aa  94  6e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000846786  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1689  hypothetical protein  50.94 
 
 
111 aa  92  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3729  hypothetical protein  50.94 
 
 
111 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00810211  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1615  hypothetical protein  50.94 
 
 
111 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.144483  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1440  hypothetical protein  52.34 
 
 
112 aa  90.9  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0126756  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1483  DivIVA family protein  50 
 
 
111 aa  90.1  8e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0858714  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1467  hypothetical protein  51.4 
 
 
112 aa  89  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.726757  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1439  cell division protein DivIVA  51.4 
 
 
112 aa  89  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1583  hypothetical protein  51.4 
 
 
112 aa  89  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1653  hypothetical protein  51.4 
 
 
112 aa  89  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0166292 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1727  hypothetical protein  51.4 
 
 
112 aa  89  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0573883  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2379  cell division protein GpsB  43.75 
 
 
98 aa  80.1  0.000000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0923  cell division protein GpsB  41.67 
 
 
120 aa  78.6  0.00000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.932524  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1818  cell division initiation protein  40.65 
 
 
128 aa  78.6  0.00000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000693197  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0280  cell division protein GpsB  45.37 
 
 
110 aa  76.3  0.0000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000392973  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0302  cell division protein GpsB  39.81 
 
 
110 aa  75.9  0.0000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000377139  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1906  cell division protein GpsB  40.57 
 
 
98 aa  67.4  0.00000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000967247  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0653  cell division initiation protein  29.27 
 
 
132 aa  55.8  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000184885  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1022  cell division initiation protein  30.4 
 
 
145 aa  45.4  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0760  cell division initiation protein  42.86 
 
 
289 aa  42.7  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0572  hypothetical protein  31.03 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  decreased coverage  0.00894752  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0862  hypothetical protein  41.67 
 
 
184 aa  41.6  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00599598  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5755  DivIVA family protein  33.78 
 
 
273 aa  40.8  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09260  DivIVA family protein  40.98 
 
 
168 aa  40.4  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00480127  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1888  DivIVA family protein  44.44 
 
 
161 aa  40.4  0.008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000234515  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3191  DivIVA family protein  34.29 
 
 
225 aa  40  0.01  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.178239 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1297  DivIVA domain protein  37.7 
 
 
168 aa  40  0.01  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>