22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0709 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0709  hypothetical protein  100 
 
 
144 aa  298  2e-80  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.230162  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1179  hypothetical protein  73.61 
 
 
144 aa  233  8e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.626624  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1201  hypothetical protein  73.61 
 
 
144 aa  233  8e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.446428  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1868  protein of unknown function DUF1333  48 
 
 
148 aa  122  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0996  protein of unknown function DUF1333  42.4 
 
 
148 aa  104  4e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0154182  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1204  ComK regulator  42.4 
 
 
150 aa  101  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.881637  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4035  ComK regulator  42.4 
 
 
150 aa  101  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.409059  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3760  hypothetical protein  44 
 
 
150 aa  100  8e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.421009  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3845  ComK regulator  41.6 
 
 
150 aa  99.8  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000211611  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3676  hypothetical protein  41.6 
 
 
150 aa  99.8  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3693  hypothetical protein  41.6 
 
 
150 aa  99.4  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00031705  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4143  ComK regulator  41.6 
 
 
150 aa  99.8  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3948  ComK regulator  41.6 
 
 
150 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3980  ComK regulator  41.6 
 
 
150 aa  97.8  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.223016  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4048  ComK regulator  41.6 
 
 
150 aa  97.8  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000178965  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2636  hypothetical protein  40 
 
 
150 aa  95.5  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000734565  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2423  hypothetical protein  20.44 
 
 
143 aa  43.9  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1429  hypothetical protein  21.01 
 
 
143 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0396  hypothetical protein  23.94 
 
 
149 aa  43.5  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000916419  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3542  hypothetical protein  20.29 
 
 
143 aa  42.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0563349  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3870  hypothetical protein  20.29 
 
 
143 aa  42  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1198  protein of unknown function DUF1333  18.71 
 
 
145 aa  42  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000161761  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>