33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_4130 on replicon NC_009430
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009430  Rsph17025_4130  hypothetical protein  100 
 
 
67 aa  136  8.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1122  transposase mutator type  70.77 
 
 
422 aa  93.6  7e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.370591  normal  0.143118 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0049  transposase mutator type  70.77 
 
 
422 aa  93.6  7e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2616  transposase mutator type  69.23 
 
 
422 aa  92  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.938771  normal 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6425  transposase mutator type  67.69 
 
 
422 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0443  putative transposase  52.38 
 
 
89 aa  75.9  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0636053  normal  0.756638 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0186  transposase mutator type  53.7 
 
 
424 aa  63.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.183961 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0135  transposase mutator type  53.7 
 
 
424 aa  63.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0038  transposase mutator type  53.7 
 
 
424 aa  63.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0005  transposase mutator type  53.7 
 
 
424 aa  63.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3096  transposase mutator type  53.7 
 
 
424 aa  63.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.312231  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2717  transposase mutator type  53.7 
 
 
424 aa  64.3  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.875305  hitchhiker  0.000051751 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0119  transposase mutator type  53.7 
 
 
386 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0826  hypothetical protein  68.42 
 
 
56 aa  61.6  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3201  transposase, mutator type  49.12 
 
 
415 aa  58.2  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0375462  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2146  transposase, mutator type  49.12 
 
 
415 aa  58.2  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1631  transposase, mutator type  49.12 
 
 
415 aa  58.2  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2156  transposase, mutator type  41.54 
 
 
417 aa  57  0.00000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0191719  normal  0.0398782 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0981  transposase mutator type  41.54 
 
 
424 aa  53.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1130  transposase mutator type  41.54 
 
 
424 aa  53.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00513551 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0882  transposase mutator type  41.54 
 
 
424 aa  53.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.031699  normal  0.346969 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1277  transposase mutator type  41.54 
 
 
424 aa  53.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1388  transposase mutator type  41.54 
 
 
424 aa  53.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1437  transposase mutator type  41.54 
 
 
424 aa  53.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1810  transposase mutator type  41.54 
 
 
424 aa  53.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.214084  hitchhiker  0.00000000849882 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0407  transposase mutator type  41.54 
 
 
424 aa  53.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.994637  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2799  transposase, mutator type  47.17 
 
 
417 aa  52  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.855527  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3986  transposase, mutator type  47.17 
 
 
226 aa  52  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.213719  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3955  transposase, mutator type  47.17 
 
 
417 aa  52  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1721  transposase, mutator type  38.46 
 
 
417 aa  49.3  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0295  transposase  38.78 
 
 
421 aa  43.9  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4322  mutator family transposase  38.78 
 
 
421 aa  43.9  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.70031  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1330  ISAfe2, transposase  35.29 
 
 
420 aa  41.2  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.423267  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>