12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2625 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2625  hypothetical protein  100 
 
 		 219 aa  450  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2848  hypothetical protein  72.6 
 
 		 220 aa  316  2e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1186  hypothetical protein  72.6 
 
 		 220 aa  315  3e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3859  hypothetical protein  38.67 
 
 		 253 aa  97.1  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.014632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4135  hypothetical protein  30.1 
 
 		 222 aa  65.5  0.0000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.182102 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03899  predicted lipoprotein  28.33 
 
 		 212 aa  45.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4003  hypothetical protein  28.33 
 
 		 212 aa  45.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.401316 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4488  hypothetical protein  27.5 
 
 		 212 aa  44.3  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03859  hypothetical protein  28.33 
 
 		 212 aa  45.1  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3970  conserved hypothetical protein  27.5 
 
 		 212 aa  44.3  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4266  hypothetical protein  27.5 
 
 		 222 aa  43.1  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4575  hypothetical protein  27.5 
 
 		 222 aa  43.5  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>