24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0952 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0952  hypothetical protein  100 
 
 		 66 aa  138  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.938842  normal  0.0299289 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0887  hypothetical protein  93.94 
 
 		 66 aa  132  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.981271  normal  0.0696523 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1022  hypothetical protein  87.88 
 
 		 66 aa  124  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.433124  normal  0.431545 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1061  hypothetical protein  75 
 
 		 78 aa  108  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.934196  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0335  hypothetical protein  59.09 
 
 		 85 aa  87.8  5e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1765  hypothetical protein  54.55 
 
 		 74 aa  86.3  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0504773  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1261  hypothetical protein  58.06 
 
 		 71 aa  85.5  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00450437  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1912  pressure-regulated protein  59.09 
 
 		 79 aa  84  7e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.348947  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1121  hypothetical protein  50 
 
 		 69 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0704  hypothetical protein  56.45 
 
 		 69 aa  80.5  0.000000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0070  hypothetical protein  51.52 
 
 		 68 aa  79.7  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0302  hypothetical protein  49.18 
 
 		 172 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00596273  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0814  hypothetical protein  58.62 
 
 		 95 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2694  hypothetical protein  52.31 
 
 		 69 aa  74.3  0.0000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0775  hypothetical protein  58.62 
 
 		 100 aa  73.9  0.0000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.186376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1721  hypothetical protein  50 
 
 		 70 aa  73.2  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.714124 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3496  hypothetical protein  48.33 
 
 		 66 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0881  hypothetical protein  48.39 
 
 		 71 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.999097  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1008  hypothetical protein  50.91 
 
 		 75 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53450  hypothetical protein  50.88 
 
 		 66 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00993995  normal  0.0130704 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1073  hypothetical protein  46.77 
 
 		 153 aa  63.9  0.0000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.177895  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1170  hypothetical protein  47.27 
 
 		 75 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3643  hypothetical protein  49.12 
 
 		 94 aa  60.8  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0800  hypothetical protein  50 
 
 		 54 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0895866 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>