14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1787 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1787  phenol hydroxylase subunit  100 
 
 		 65 aa  137  7e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.982005 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1699  hypothetical protein  67.44 
 
 		 84 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.542066  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2285  phenol hydrolase assembly protein  69.05 
 
 		 95 aa  58.5  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08860  Phenol hydroxylase subunit DmpK  48 
 
 		 85 aa  57  0.00000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30760  Multi-component phenol hydoxylase, assembly subunit; LapK  52.08 
 
 		 88 aa  54.7  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2971  phenol hydroxylase subunit  52 
 
 		 76 aa  50.4  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3311  phenol hydroxylase subunit  57.45 
 
 		 85 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3309  phenol hydrolase assembly protein  41.27 
 
 		 103 aa  50.1  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.143126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3797  phenol hydroxylase subunit  46.94 
 
 		 89 aa  48.5  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.070341  hitchhiker  0.00219464 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0206  phenol hydroxylase subunit  46.94 
 
 		 71 aa  48.1  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3116  Phenol hydroxylase subunit  36.73 
 
 		 89 aa  45.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.185842  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1331  phenol hydroxylase subunit  40.82 
 
 		 74 aa  44.7  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.658986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3363  phenol hydroxylase subunit  50 
 
 		 76 aa  44.3  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2796  phenol hydroxylase subunit  51.22 
 
 		 80 aa  41.6  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.276031 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>