19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0646 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0646  hypothetical protein  100 
 
 		 115 aa  231  3e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.52468  normal  0.382564 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2645  putative lipoprotein  75.76 
 
 		 114 aa  149  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.367227  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0590  putative lipoprotein  61.9 
 
 		 112 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.126404 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2269  hypothetical protein  43.84 
 
 		 101 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.557007  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5997  hypothetical protein  36.59 
 
 		 98 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.259981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6293  hypothetical protein  38.67 
 
 		 98 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.406477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3086  hypothetical protein  42.47 
 
 		 101 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2961  hypothetical protein  42.47 
 
 		 101 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.507112  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6371  hypothetical protein  40.85 
 
 		 98 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.185091  normal  0.669684 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0547  lipoprotein  40.35 
 
 		 102 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.415478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5497  hypothetical protein  40.85 
 
 		 106 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0322935  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6783  hypothetical protein  40.85 
 
 		 106 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.031126  normal  0.0589764 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5322  putative lipoprotein  35.9 
 
 		 95 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0697034  decreased coverage  0.000269029 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7200  hypothetical protein  41.56 
 
 		 108 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0315017  normal  0.471372 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0654  lipoprotein  44.44 
 
 		 102 aa  50.8  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.691799  normal  0.365168 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4615  putative lipoprotein  35.29 
 
 		 97 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.156329  normal  0.250438 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2550  hypothetical protein  30.26 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0796987  normal  0.0950916 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2359  hypothetical protein  34.72 
 
 		 129 aa  44.7  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0794  putative lipoprotein  38.1 
 
 		 93 aa  40.4  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.012398  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>