21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1293 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_1293  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
307 aa  623  1e-177  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.384071  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1472  metal dependent phosphohydrolase  39.5 
 
 
273 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.309943  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1665  metal dependent phosphohydrolase  38.59 
 
 
272 aa  163  3e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0160653 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1038  metal dependent phosphohydrolase  38.66 
 
 
273 aa  162  8.000000000000001e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.791938  hitchhiker  0.0000298084 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1538  metal dependent phosphohydrolase  36.13 
 
 
274 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.360301 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0292  metal dependent phosphohydrolase  37.39 
 
 
258 aa  153  2.9999999999999998e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0551  metal dependent phosphohydrolase  40.97 
 
 
297 aa  143  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0543  metal dependent phosphohydrolase  39.91 
 
 
253 aa  143  4e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2283  hypothetical protein  37.72 
 
 
296 aa  135  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.319974  hitchhiker  0.0000000910717 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0458  metal dependent phosphohydrolase  35.65 
 
 
299 aa  134  3e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0212858 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2070  hypothetical protein  35.06 
 
 
310 aa  132  5e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.938257  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1594  hypothetical protein  38.43 
 
 
360 aa  125  6e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4554  metal dependent phosphohydrolase  35.8 
 
 
288 aa  124  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.140981  normal  0.756773 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0111  metal dependent phosphohydrolase  32.93 
 
 
267 aa  124  2e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.479676  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0666  metal dependent phosphohydrolase  31.95 
 
 
311 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.010812 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1687  metal dependent phosphohydrolase  32.71 
 
 
297 aa  106  4e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2568  metal dependent phosphohydrolase  32.78 
 
 
271 aa  105  1e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.344156 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3132  metal dependent phosphohydrolase  29.09 
 
 
291 aa  103  3e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.686075  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0268  metal dependent phosphohydrolase  33.2 
 
 
277 aa  101  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0940  metal dependent phosphohydrolase  28.38 
 
 
271 aa  99.8  5e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4075  metal dependent phosphohydrolase  31.71 
 
 
290 aa  45.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.574671  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>