13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0168 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_0168  hypothetical protein  100 
 
 
146 aa  296  5e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.408233  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5200  hypothetical protein  60.8 
 
 
131 aa  155  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0844  hypothetical protein  56.91 
 
 
124 aa  147  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.52232  normal  0.0548204 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1973  hypothetical protein  45.97 
 
 
125 aa  105  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8676  hypothetical protein  41.94 
 
 
126 aa  95.5  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1050  hypothetical protein  39.84 
 
 
132 aa  92.4  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.170913 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3626  hypothetical protein  39.02 
 
 
125 aa  82.4  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.513486  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2695  hypothetical protein  36.07 
 
 
124 aa  71.6  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.933543 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0776  hypothetical protein  33.91 
 
 
124 aa  66.6  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.240872  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1691  Uncharacterized conserved protein UCP028498  41.46 
 
 
138 aa  65.5  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.865455  normal  0.377935 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4125  hypothetical protein  34.4 
 
 
126 aa  62.8  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4598  hypothetical protein  32.52 
 
 
127 aa  57  0.00000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.931088  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1626  hypothetical protein  27.78 
 
 
122 aa  51.6  0.000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>