14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_7096 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012858  Rleg_7096  hypothetical protein  100 
 
 
118 aa  244  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.21263  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1616  hypothetical protein  49.37 
 
 
87 aa  77.4  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.639489 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4610  hypothetical protein  28.41 
 
 
90 aa  46.6  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.553384  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0406  hypothetical protein  27.71 
 
 
88 aa  45.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1705  hypothetical protein  25 
 
 
91 aa  44.3  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5114  hypothetical protein  29.49 
 
 
98 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2131  hypothetical protein  31.82 
 
 
91 aa  43.9  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0894  hypothetical protein  27.06 
 
 
90 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00183124  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1286  hypothetical protein  23.86 
 
 
90 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.3216500000000004e-18 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4336  hypothetical protein  26.14 
 
 
90 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.022904  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1930  hypothetical protein  32.05 
 
 
93 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3576  hypothetical protein  26.14 
 
 
90 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.221494  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2377  hypothetical protein  28.24 
 
 
90 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0704345  hitchhiker  0.00399163 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0656  hypothetical protein  34.94 
 
 
82 aa  40.8  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>