33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0568 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0568  hypothetical protein  100 
 
 
75 aa  149  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0524  hypothetical protein  92 
 
 
75 aa  135  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.248456  normal  0.33753 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0944  hypothetical protein  72.6 
 
 
112 aa  105  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0459  hypothetical protein  75.34 
 
 
73 aa  103  7e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.555176 
 
 
-
 
NC_004310  BR0400  hypothetical protein  64 
 
 
75 aa  95.9  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0518  hypothetical protein  66.22 
 
 
74 aa  95.5  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0409  hypothetical protein  64 
 
 
79 aa  95.5  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.500271  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0710  hypothetical protein  67.16 
 
 
74 aa  89.7  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0933302  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3426  hypothetical protein  60.27 
 
 
75 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.522306 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3300  hypothetical protein  58.67 
 
 
75 aa  87.4  6e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.561941  normal  0.761211 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3107  hypothetical protein  57.33 
 
 
75 aa  87  9e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.147457 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2350  hypothetical protein  58.33 
 
 
75 aa  80.1  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.103145 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5346  hypothetical protein  53.42 
 
 
74 aa  77.4  0.00000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1374  hypothetical protein  53.42 
 
 
75 aa  77  0.00000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2754  hypothetical protein  53.42 
 
 
77 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4374  hypothetical protein  52.05 
 
 
77 aa  75.5  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1215  hypothetical protein  52.78 
 
 
75 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1089  hypothetical protein  51.39 
 
 
75 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.614221 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1233  hypothetical protein  55.56 
 
 
75 aa  72  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4353  hypothetical protein  50 
 
 
75 aa  71.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.107757  normal  0.0188618 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2591  hypothetical protein  52.78 
 
 
84 aa  69.3  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.110444 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2405  hypothetical protein  47.76 
 
 
71 aa  67.8  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.368426  normal  0.694477 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0749  hypothetical protein  47.76 
 
 
71 aa  67.8  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3071  hypothetical protein  46.88 
 
 
75 aa  63.9  0.0000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3741  hypothetical protein  46.27 
 
 
75 aa  62.4  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.6246  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0723  hypothetical protein  47.06 
 
 
71 aa  62  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.549756  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1114  hypothetical protein  55.56 
 
 
74 aa  61.6  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2030  hypothetical protein  51.56 
 
 
70 aa  58.9  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.979837  normal  0.192843 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3935  hypothetical protein  43.66 
 
 
73 aa  58.5  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.199475  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2183  hypothetical protein  44.59 
 
 
71 aa  54.3  0.0000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0488  hypothetical protein  48.98 
 
 
73 aa  50.4  0.000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2951  hypothetical protein  40.3 
 
 
70 aa  48.5  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.361374  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0974  hypothetical protein  31.34 
 
 
104 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.555742 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>