More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3052 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3052  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 233 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0091  cell division protein FtsZ  35.61 
 
 		 351 aa  97.4  1e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000655014  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0091  cell division protein FtsZ  35.12 
 
 		 351 aa  95.9  4e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.206077  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0423  cell division protein FtsZ  35 
 
 		 381 aa  91.3  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.000000000000106624  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0059  cell division protein FtsZ  30.77 
 
 		 427 aa  88.2  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.000000000225371  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2263  cell division protein FtsZ  34.78 
 
 		 387 aa  87.8  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00432482  hitchhiker  0.000536698 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2498  cell division protein FtsZ  29.8 
 
 		 430 aa  87.4  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.103789  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0164  cell division protein FtsZ  34.85 
 
 		 369 aa  87  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000556995  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2105  cell division protein FtsZ  29.15 
 
 		 436 aa  85.1  8e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.535546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0174  cell division protein FtsZ  36.63 
 
 		 375 aa  84.7  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.179646  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1275  cell division protein FtsZ  34.52 
 
 		 364 aa  84.3  0.000000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0125  cell division protein FtsZ  35 
 
 		 380 aa  82.8  0.000000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0593594  normal  0.066745 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1204  cell division protein FtsZ  36.53 
 
 		 427 aa  82  0.000000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.382844  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2890  cell division protein FtsZ  28.72 
 
 		 430 aa  82  0.000000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000804366  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0009  cell division protein FtsZ  33.33 
 
 		 333 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.428293  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0099  cell division protein FtsZ  43.4 
 
 		 372 aa  80.5  0.00000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1698  cell division protein FtsZ  34.18 
 
 		 454 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2517  cell division protein FtsZ  28.21 
 
 		 420 aa  79.7  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0305  cell division protein FtsZ  37.21 
 
 		 399 aa  79.7  0.00000000000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2172  cell division protein FtsZ  35.5 
 
 		 513 aa  79  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0335477  normal  0.0236284 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2716  cell division protein FtsZ  28.21 
 
 		 431 aa  79.3  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0707942  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3493  cell division protein FtsZ  32.67 
 
 		 398 aa  78.6  0.00000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00398885  normal  0.338691 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0151  cell division protein FtsZ  31.28 
 
 		 361 aa  77.8  0.0000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000169065  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1139  cell division protein FtsZ  34.98 
 
 		 491 aa  78.2  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0363  cell division protein FtsZ  39.84 
 
 		 371 aa  78.2  0.0000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000000281943  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1428  cell division protein FtsZ  38.21 
 
 		 371 aa  77.8  0.0000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0148708  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0527  cell division protein FtsZ  35.1 
 
 		 405 aa  77.8  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2488  cell division protein FtsZ  33.33 
 
 		 389 aa  77  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0022713  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1374  cell division protein FtsZ  33.91 
 
 		 379 aa  77  0.0000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000577452  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0069  cell division protein FtsZ  38.58 
 
 		 522 aa  75.1  0.0000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0571  cell division protein FtsZ  45.54 
 
 		 384 aa  75.1  0.0000000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0343  cell division protein FtsZ  35.88 
 
 		 376 aa  74.7  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000013654  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0322  cell division protein FtsZ  35.88 
 
 		 376 aa  74.7  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000212149  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0747  cell division protein FtsZ  32.51 
 
 		 360 aa  74.7  0.000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.301526  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7436  cell division protein FtsZ  38.35 
 
 		 606 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412749  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00906  cell division protein FtsZ  34.95 
 
 		 415 aa  74.7  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_284  cell division protein FtsZ  35.88 
 
 		 376 aa  74.7  0.000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00407884  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6104  cell division protein FtsZ  32.99 
 
 		 395 aa  73.6  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0530427  normal  0.0566942 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0894  cell division protein FtsZ  28.26 
 
 		 422 aa  73.9  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0255  tubulin/FtsZ GTPase  31.28 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1843  cell division protein FtsZ  42.57 
 
 		 379 aa  73.9  0.000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00105712  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0230  cell division protein FtsZ  39.06 
 
 		 386 aa  73.6  0.000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  2.97821e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1966  cell division protein FtsZ  39.06 
 
 		 393 aa  73.2  0.000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.000000388917  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2782  cell division protein FtsZ  31.96 
 
 		 391 aa  73.6  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000504391  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1237  cell division protein FtsZ  32.02 
 
 		 360 aa  73.2  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0681  cell division protein FtsZ  31.16 
 
 		 370 aa  72.8  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.854836 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0417  cell division protein FtsZ  36.16 
 
 		 384 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.857651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004486  cell division protein FtsZ  34.41 
 
 		 412 aa  73.2  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000238427  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4668  cell division protein FtsZ  35.52 
 
 		 398 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000910639  normal  0.472139 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2258  cell division protein FtsZ  31.25 
 
 		 428 aa  72.4  0.000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000330912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0139  cell division protein FtsZ  34.73 
 
 		 356 aa  72.4  0.000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1342  cell division protein FtsZ  36.07 
 
 		 398 aa  72  0.000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00615474  decreased coverage  0.0000964592 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4382  cell division protein FtsZ  36.07 
 
 		 398 aa  72  0.000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000000271138  normal  0.178882 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4403  cell division protein FtsZ  35.52 
 
 		 395 aa  72  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00309218  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4097  cell division protein FtsZ  35.52 
 
 		 395 aa  72  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0231249  normal  0.411425 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4507  cell division protein FtsZ  36.07 
 
 		 398 aa  72  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000253019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0949  cell division protein FtsZ  36.07 
 
 		 398 aa  72  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0337726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0025  cell division protein FtsZ  31.6 
 
 		 593 aa  72  0.000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0142  cell division protein FtsZ  31.03 
 
 		 360 aa  72  0.000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1635  cell division protein FtsZ  32.35 
 
 		 361 aa  71.6  0.000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0490089  normal  0.332541 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0853  cell division protein FtsZ  34.32 
 
 		 390 aa  71.2  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000155156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2471  cell division protein FtsZ  31.82 
 
 		 410 aa  71.2  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000969282  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_576  cell division protein FtsZ  33.33 
 
 		 376 aa  70.9  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0921077  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0636  cell division protein FtsZ  33.33 
 
 		 376 aa  70.5  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.229597  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0497  cell division protein FtsZ  35.67 
 
 		 386 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000633261  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0514  cell division protein FtsZ  35.67 
 
 		 386 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0608  cell division protein FtsZ  33.33 
 
 		 376 aa  70.9  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.019087  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0927  cell division protein FtsZ  34.97 
 
 		 397 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000000829839  normal  0.686673 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0390  cell division protein FtsZ  30.23 
 
 		 379 aa  69.7  0.00000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.402972  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1667  cell division protein FtsZ  33 
 
 		 354 aa  70.1  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2423  cell division protein FtsZ  34.22 
 
 		 382 aa  69.7  0.00000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0258249  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1308  cell division protein FtsZ  33.51 
 
 		 361 aa  69.3  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0955764  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0901  cell division protein FtsZ  29.8 
 
 		 386 aa  69.7  0.00000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.363847 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2975  cell division protein FtsZ  32.84 
 
 		 409 aa  69.7  0.00000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00368493  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2187  cell division protein FtsZ  31.72 
 
 		 379 aa  69.7  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0151273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5023  cell division protein FtsZ  37.21 
 
 		 418 aa  69.7  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3665  cell division protein FtsZ  32.84 
 
 		 409 aa  69.7  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0666491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04362  cell division protein FtsZ  31.18 
 
 		 396 aa  69.3  0.00000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.724389  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48370  predicted protein  30.92 
 
 		 429 aa  69.3  0.00000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.233264  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57275  cell division protein FtsZ  34.43 
 
 		 394 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000484485  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0924  cell division protein FtsZ  33.82 
 
 		 406 aa  68.9  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00449879  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03253  cell division protein FtsZ  36.65 
 
 		 202 aa  68.9  0.00000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000001944  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2662  cell division protein FtsZ  30.27 
 
 		 398 aa  68.6  0.00000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0191  cell division protein FtsZ  34.69 
 
 		 392 aa  68.6  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0529  cell division protein FtsZ  31.48 
 
 		 397 aa  68.6  0.00000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000385556  hitchhiker  0.0000000388355 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4979  cell division protein FtsZ  34.43 
 
 		 394 aa  68.9  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.0056047  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1942  cell division protein FtsZ  29.8 
 
 		 368 aa  68.9  0.00000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.000000000000184944  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2185  cell division protein FtsZ  33.13 
 
 		 394 aa  68.9  0.00000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.0000000751691  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2085  cell division protein FtsZ  32.98 
 
 		 386 aa  68.6  0.00000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.150448  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3502  cell division protein FtsZ  33.99 
 
 		 389 aa  68.6  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000267665  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3757  cell division protein FtsZ  37.96 
 
 		 363 aa  68.6  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.853491  normal  0.171688 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2532  cell division protein FtsZ  30.27 
 
 		 398 aa  68.6  0.00000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1745  cell division protein FtsZ  36.64 
 
 		 398 aa  68.6  0.00000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.00000000000013123  normal  0.221257 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2027  cell division protein FtsZ  36.64 
 
 		 398 aa  68.6  0.00000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000130635  normal  0.845154 
 
 
 
NC_011901  Tgr7_0775  cell division protein FtsZ  33.33 
 
 		 384 aa  68.2  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0613024  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2265  cell division protein FtsZ  31.28 
 
 		 363 aa  67.8  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  unclonable  0.00000000186575  normal  0.0490734 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0890  cell division protein FtsZ  30.46 
 
 		 368 aa  68.2  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0281194  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1373  cell division protein FtsZ  31.79 
 
 		 392 aa  67.8  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4575  cell division protein FtsZ  34.48 
 
 		 413 aa  68.2  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00213965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1286  cell division protein FtsZ  32.42 
 
 		 607 aa  67.4  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>