19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0333 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_0333  hypothetical protein  100 
 
 
174 aa  363  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2410  hypothetical protein  48.94 
 
 
166 aa  150  1e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.024377  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0073  hypothetical protein  47.4 
 
 
175 aa  142  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.237178  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2731  hypothetical protein  34.62 
 
 
167 aa  111  6e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.519e-16 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2745  hypothetical protein  34.19 
 
 
167 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.013828  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2532  hypothetical protein  34.62 
 
 
174 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.267417  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2718  hypothetical protein  34.62 
 
 
174 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.480613  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2457  hypothetical protein  34.84 
 
 
174 aa  110  9e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.365585  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2736  hypothetical protein  34.36 
 
 
167 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2780  hypothetical protein  34.62 
 
 
167 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.770792  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2492  hypothetical protein  34.62 
 
 
174 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000120653  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2566  hypothetical protein  34.84 
 
 
167 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00857002 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2141  hypothetical protein  37.59 
 
 
167 aa  105  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0748103  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0321  hypothetical protein  34.52 
 
 
166 aa  97.4  9e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0394  hypothetical protein  35.71 
 
 
146 aa  92.4  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0314819  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0384  hypothetical protein  35.71 
 
 
146 aa  92.4  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.104953  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2332  hypothetical protein  29.66 
 
 
167 aa  79.3  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0282  protein of unknown function UCP032285  33.08 
 
 
144 aa  71.2  0.000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1970  hypothetical protein  32.99 
 
 
102 aa  67.4  0.00000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>