57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0173 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_0173  hypothetical protein  100 
 
 
118 aa  222  2e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2135  hypothetical protein  33.33 
 
 
141 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1946  sporulation protein YtfJ  35.19 
 
 
141 aa  61.6  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2111  hypothetical protein  34.26 
 
 
141 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2181  hypothetical protein  34.26 
 
 
141 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0698521  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1953  hypothetical protein  34.26 
 
 
141 aa  60.5  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1932  hypothetical protein  34.26 
 
 
141 aa  60.5  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2195  hypothetical protein  34.26 
 
 
141 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.384624  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1908  hypothetical protein  34.26 
 
 
141 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2101  hypothetical protein  34.26 
 
 
141 aa  60.5  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07200  Sporulation protein YtfJ  33.03 
 
 
128 aa  57.8  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000517088  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1314  sporulation protein YtfJ  30.7 
 
 
135 aa  54.3  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000116543  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1482  hypothetical protein  28.95 
 
 
155 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1511  hypothetical protein  30.7 
 
 
195 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1277  hypothetical protein  28.95 
 
 
155 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000484756  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1570  hypothetical protein  30.33 
 
 
148 aa  53.9  0.0000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000329369  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1550  hypothetical protein  28.95 
 
 
133 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00888341  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3899  hypothetical protein  28.95 
 
 
155 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1276  hypothetical protein  29.82 
 
 
155 aa  52.8  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1414  hypothetical protein  31.78 
 
 
136 aa  52.8  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.173147  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1444  hypothetical protein  29.82 
 
 
155 aa  52  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1117  sporulation protein YtfJ  28.21 
 
 
137 aa  51.6  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.065472  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2058  hypothetical protein  36.79 
 
 
139 aa  49.7  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.836973  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1772  hypothetical protein  36.79 
 
 
139 aa  49.7  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1906  hypothetical protein  32.17 
 
 
116 aa  50.1  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1587  hypothetical protein  35.19 
 
 
141 aa  49.7  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0728  sporulation protein YtfJ  28.21 
 
 
148 aa  48.9  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1358  hypothetical protein  34.21 
 
 
159 aa  49.3  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0908  hypothetical protein  39.47 
 
 
119 aa  48.9  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.559032  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2894  hypothetical protein  33.33 
 
 
137 aa  48.9  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000420762  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1744  sporulation protein YtfJ  27.97 
 
 
152 aa  48.1  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4749  hypothetical protein  33.33 
 
 
131 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3203  hypothetical protein  33.33 
 
 
141 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0486  hypothetical protein  33.33 
 
 
131 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.239832 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2711  sporulation protein YtfJ  30.63 
 
 
142 aa  47  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1297  sporulation protein YtfJ  32.43 
 
 
138 aa  47.4  0.00008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4758  hypothetical protein  32.38 
 
 
131 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4775  hypothetical protein  32.38 
 
 
131 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4538  hypothetical protein  32.38 
 
 
131 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.504702  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4776  hypothetical protein  32.38 
 
 
131 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4374  hypothetical protein  32.38 
 
 
131 aa  45.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4891  hypothetical protein  32.38 
 
 
131 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4384  hypothetical protein  32.38 
 
 
131 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4471  sporulation protein YtfJ  32.38 
 
 
131 aa  45.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0378  hypothetical protein  43.62 
 
 
129 aa  45.4  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2872  hypothetical protein  35.19 
 
 
149 aa  44.7  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.449362  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1303  hypothetical protein  29.82 
 
 
155 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000210058  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1411  hypothetical protein  29.82 
 
 
135 aa  43.9  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.875133  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1138  hypothetical protein  29.31 
 
 
146 aa  43.5  0.0009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0808  hypothetical protein  43.16 
 
 
155 aa  43.5  0.0009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3313  hypothetical protein  30.48 
 
 
131 aa  43.5  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1733  sporulation protein YtfJ  28.57 
 
 
134 aa  43.5  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0006  hypothetical protein  34.07 
 
 
142 aa  42.7  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0464153 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3422  sporulation protein YtfJ  23.85 
 
 
149 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0691  hypothetical protein  27.73 
 
 
162 aa  41.6  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0796  sporulation protein YtfJ  25.74 
 
 
127 aa  41.2  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1649  sporulation protein YtfJ  32.43 
 
 
154 aa  40.8  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.592174 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>