104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4473 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4473  hypothetical protein  100 
 
 		 84 aa  167  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.298011  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3997  hypothetical protein  87.32 
 
 		 76 aa  127  7.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000937208  normal  0.526601 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1138  hypothetical protein  83.33 
 
 		 70 aa  111  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.688094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1006  hypothetical protein  73.24 
 
 		 77 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0687229  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3165  hypothetical protein  74.29 
 
 		 121 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3527  hypothetical protein  79.41 
 
 		 71 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0124058 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1569  hypothetical protein  80.95 
 
 		 73 aa  108  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.269549  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3201  hypothetical protein  79.41 
 
 		 71 aa  108  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0712  hypothetical protein  77.94 
 
 		 70 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.18469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2842  hypothetical protein  75 
 
 		 96 aa  107  6e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.263713 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3333  hypothetical protein  81.54 
 
 		 71 aa  106  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2733  hypothetical protein  78.46 
 
 		 70 aa  106  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.23582  normal  0.189049 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2512  hypothetical protein  73.91 
 
 		 83 aa  105  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1303  hypothetical protein  80 
 
 		 79 aa  105  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.921638  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1123  hypothetical protein  80 
 
 		 79 aa  104  5e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.257596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2058  hypothetical protein  76.92 
 
 		 70 aa  103  8e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2623  hypothetical protein  76.92 
 
 		 71 aa  103  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.82833 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1640  putative cytoplasmic protein  72.31 
 
 		 70 aa  103  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.458938 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0320  hypothetical protein  78.46 
 
 		 77 aa  102  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4358  hypothetical protein  75.76 
 
 		 78 aa  102  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2479  putative cytoplasmic protein  73.85 
 
 		 92 aa  101  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.878224 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1761  putative cytoplasmic protein  72.31 
 
 		 70 aa  100  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.359714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5616  hypothetical protein  65.79 
 
 		 76 aa  96.7  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00760033  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5980  hypothetical protein  65.79 
 
 		 76 aa  96.7  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000584945  hitchhiker  0.000768917 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1758  hypothetical protein  69.23 
 
 		 70 aa  95.5  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6473  hypothetical protein  74.6 
 
 		 71 aa  95.5  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.248034 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0796  hypothetical protein  70.77 
 
 		 95 aa  94.7  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0396  hypothetical protein  73.44 
 
 		 90 aa  94.7  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0819  hypothetical protein  70.77 
 
 		 73 aa  93.6  9e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.234689 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6204  hypothetical protein  73.02 
 
 		 80 aa  92.4  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7365  hypothetical protein  75 
 
 		 71 aa  92  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.392784 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0821  hypothetical protein  68.66 
 
 		 68 aa  91.3  4e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.505184  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0830  hypothetical protein  69.23 
 
 		 73 aa  91.3  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.384212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4397  hypothetical protein  69.23 
 
 		 73 aa  90.9  6e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0362  hypothetical protein  63.77 
 
 		 80 aa  89  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5933  hypothetical protein  76.36 
 
 		 67 aa  87.4  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.580677 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0363  hypothetical protein  60.87 
 
 		 80 aa  84  6e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.862726 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1413  hypothetical protein  50.75 
 
 		 75 aa  81.3  0.000000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.000000666979  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0021  hypothetical protein  52.94 
 
 		 71 aa  80.9  0.000000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4969  hypothetical protein  54.29 
 
 		 75 aa  79.3  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0328505  normal  0.230357 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4912  hypothetical protein  54.41 
 
 		 77 aa  76.3  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.590733  normal  0.204224 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2567  hypothetical protein  51.43 
 
 		 71 aa  75.9  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0905  hypothetical protein  52.24 
 
 		 78 aa  75.1  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.128599  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0992  hypothetical protein  48.57 
 
 		 75 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3268  hypothetical protein  48.57 
 
 		 75 aa  70.5  0.000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17590  hypothetical protein  50.75 
 
 		 73 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3682  hypothetical protein  52.31 
 
 		 87 aa  69.3  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0904842  normal  0.179563 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1529  hypothetical protein  50.75 
 
 		 73 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.378404  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3376  hypothetical protein  50.75 
 
 		 80 aa  68.6  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.524474 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0146  hypothetical protein  50.75 
 
 		 74 aa  67  0.00000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2913  hypothetical protein  54.55 
 
 		 57 aa  66.6  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0272  hypothetical protein  50.75 
 
 		 74 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2899  hypothetical protein  47.62 
 
 		 71 aa  65.9  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0872463 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1296  hypothetical protein  48.48 
 
 		 74 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.772792  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3002  hypothetical protein  48.48 
 
 		 69 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3017  hypothetical protein  48.48 
 
 		 69 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3160  hypothetical protein  48.48 
 
 		 69 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.569595  hitchhiker  0.00557664 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1361  hypothetical protein  48.48 
 
 		 69 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2368  hypothetical protein  48.39 
 
 		 68 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.251336  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2938  hypothetical protein  47.06 
 
 		 71 aa  63.9  0.0000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000302193  normal  0.0993887 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1423  hypothetical protein  48.48 
 
 		 74 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.235274 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4821  hypothetical protein  46.38 
 
 		 72 aa  63.9  0.0000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.345278  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2382  hypothetical protein  42.86 
 
 		 78 aa  63.5  0.0000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.565655  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0802  hypothetical protein  48.53 
 
 		 73 aa  63.5  0.0000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3643  hypothetical protein  45.83 
 
 		 81 aa  62.4  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2668  hypothetical protein  46.97 
 
 		 69 aa  62.4  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0012966  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05428  hypothetical protein  46.27 
 
 		 71 aa  62.8  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3443  hypothetical protein  45.71 
 
 		 71 aa  62.4  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0113209  hitchhiker  0.000381687 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1114  hypothetical protein  47.62 
 
 		 70 aa  62  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1536  hypothetical protein  45.45 
 
 		 74 aa  62  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.401028 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08466  hypothetical protein  40 
 
 		 75 aa  62  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1700  hypothetical protein  48.28 
 
 		 72 aa  61.6  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3402  hypothetical protein  45.07 
 
 		 73 aa  61.2  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1282  hypothetical protein  43.94 
 
 		 74 aa  60.5  0.000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.546336  normal  0.558712 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001485  hypothetical protein  44.78 
 
 		 71 aa  60.5  0.000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3326  hypothetical protein  45.45 
 
 		 69 aa  60.5  0.000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1216  hypothetical protein  45.45 
 
 		 69 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.080424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1287  hypothetical protein  45.45 
 
 		 69 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000361256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1108  hypothetical protein  48.39 
 
 		 71 aa  60.1  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.990525  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2372  hypothetical protein  45.59 
 
 		 97 aa  60.1  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.338576 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02201  hypothetical protein  46.97 
 
 		 71 aa  58.9  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3561  hypothetical protein  43.66 
 
 		 73 aa  59.3  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1217  hypothetical protein  43.94 
 
 		 69 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.665879 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1322  hypothetical protein  44.12 
 
 		 71 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  5.1439e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2743  hypothetical protein  44.12 
 
 		 71 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000291891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1433  hypothetical protein  44.12 
 
 		 71 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000512629  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0464  hypothetical protein  43.94 
 
 		 73 aa  58.5  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0836  hypothetical protein  46.88 
 
 		 70 aa  58.5  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02310  hypothetical protein  44.12 
 
 		 72 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000190076  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1251  conserved hypothetical protein  44.12 
 
 		 72 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000454133  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2545  hypothetical protein  44.12 
 
 		 72 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000210875  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2696  hypothetical protein  44.12 
 
 		 72 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000496691  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1268  Z3676-like protein  44.12 
 
 		 72 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000147572  hitchhiker  0.0000894237 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2564  hypothetical protein  44.12 
 
 		 72 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000205167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2771  hypothetical protein  44.12 
 
 		 72 aa  58.2  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000218032  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3640  hypothetical protein  44.12 
 
 		 72 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000039946  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02271  hypothetical protein  44.12 
 
 		 72 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000163075  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2619  hypothetical protein  42.65 
 
 		 72 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2661  hypothetical protein  42.65 
 
 		 72 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.66318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2570  hypothetical protein  42.65 
 
 		 72 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000475376  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>