12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3675 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B3675  hypothetical protein  100 
 
 
80 aa  160  7e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0136766  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3994  hypothetical protein  85.14 
 
 
77 aa  127  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00197531  normal  0.22783 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4772  hypothetical protein  73.33 
 
 
77 aa  111  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.129824  hitchhiker  0.00365437 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2000  hypothetical protein  72 
 
 
77 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0785835  normal  0.0212264 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5570  hypothetical protein  67.57 
 
 
77 aa  102  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.115413  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5935  hypothetical protein  67.57 
 
 
77 aa  102  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6437  hypothetical protein  67.57 
 
 
77 aa  102  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5048  hypothetical protein  70.67 
 
 
77 aa  101  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.957848 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2467  hypothetical protein  64.86 
 
 
77 aa  99  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.591994 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3252  hypothetical protein  40.98 
 
 
76 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5116  hypothetical protein  40.98 
 
 
76 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5165  hypothetical protein  40.98 
 
 
76 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.180758 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>